Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Tmem253Q3UNB8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Tmem253Q3UNB8 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms