Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Washc4Q3UMB9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms