Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Q3U6N9 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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