Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
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Ssbp4Q3U4B1 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Ssbp4Q3U4B1 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
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