Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ulk3Q3U3Q1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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