Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rnf40Q3U319 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Rnf40Q3U319 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf40Q3U319 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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