Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hbq1bQ3U0A6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hbq1bQ3U0A6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hbq1bQ3U0A6 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hbq1bQ3U0A6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hbq1bQ3U0A6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Hbq1bQ3U0A6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Hbq1bQ3U0A6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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