Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYD6

Lmtk2, Serine/threonine-protein kinase LMTK2, mousemouse

Predictions only

Length 1,471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmtk2Q3TYD6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Lmtk2Q3TYD6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms