Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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