Protein–RNA interactions for Protein: Q3TR08

Fndc4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc4Q3TR08 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Fndc4Q3TR08 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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