Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gtf3c3Q3TMP1 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms