Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Trappc10Q3TLI0 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms