Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Fam107bQ3TGF2 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms