Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Shroom4Q1W617 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms