Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Samd11Q1RNF8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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