Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Ttc39dQ0VF76 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms