Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Cib3Q0P523 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms