Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Znf541Q0GGX2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms