Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cnnm1Q0GA42 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cnnm1Q0GA42 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms