Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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Cnn1Q08091 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Cnn1Q08091 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
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