Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Cdx4Q07424 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms