Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Cntn3Q07409 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cntn3Q07409 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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