Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Thbs3Q05895 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms