Protein–RNA interactions for Protein: Q04690

Nf1, Neurofibromin, mousemouse

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Length 2,841 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nf1Q04690 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nf1Q04690 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nf1Q04690 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Nf1Q04690 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Nf1Q04690 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms