Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Scg2Q03517 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms