Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Top2aQ01320 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Top2aQ01320 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms