Protein–RNA interactions for Protein: Q01237

Hmgcr, 3-hydroxy-3-methylglutaryl-coenzyme A reductase, mousemouse

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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HmgcrQ01237 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
HmgcrQ01237 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
HmgcrQ01237 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
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HmgcrQ01237 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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