Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gja5Q01231 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms