Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pkp1P97350 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pkp1P97350 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms