Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Irx1P81068 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irx1P81068 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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