Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Otx1P80205 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Otx1P80205 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms