Protein–RNA interactions for Protein: P70662

Ldb1, LIM domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb1P70662 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ldb1P70662 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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