Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
SbdsP70122 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
SbdsP70122 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms