Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gnb1P62874 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gnb1P62874 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms