Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Smg6P61406 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Smg6P61406 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms