Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tpm2P58774 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tpm2P58774 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms