Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CtnsP57757 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms