Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp5P56399 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Usp5P56399 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms