Protein–RNA interactions for Protein: P56371

Rab4a, Ras-related protein Rab-4A, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab4aP56371 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rab4aP56371 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
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Rab4aP56371 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Rab4aP56371 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Rab4aP56371 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
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