Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
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Sh3bp1P55194 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh3bp1P55194 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh3bp1P55194 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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