Protein–RNA interactions for Protein: P55066

Ncan, Neurocan core protein, mousemouse

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Length 1,268 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcanP55066 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NcanP55066 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
NcanP55066 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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NcanP55066 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcanP55066 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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