Protein–RNA interactions for Protein: P53702

Hccs, Cytochrome c-type heme lyase, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HccsP53702 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
HccsP53702 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HccsP53702 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms