Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LtbrP50284 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Alg13-207ENSMUST00000149330 479 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LtbrP50284 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms