Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 B430010I23Rik-202ENSMUST00000152188 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PtpreP49446 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms