Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Epb42P49222 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Epb42P49222 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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