Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Rab11bP46638 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rab11bP46638 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rab11bP46638 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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