Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Traf1P39428 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms