Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
TtlP38585 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
TtlP38585 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtlP38585 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtlP38585 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
TtlP38585 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
TtlP38585 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms