Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
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Hoxc11P31313 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Hoxc11P31313 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Hoxc11P31313 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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