Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
NapbP28663 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NapbP28663 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NapbP28663 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms